Étude menée de 1994 à 2009 Besançon et ses demeures Étude des demeures bisontines du Moyen Âge au 19e siècle.
Étude menée en 2009 Jougne Jougne est située à la frontière franco-suisse, à 1 000 m d’altitude, sur un plateau qui surplombe la vallée de la Jougnena. Depuis le 12e siècle, sa position frontalière est l'élément déterminant de son développement.
Étude menée entre 2006 et 2008 Canton de Saint-Seine-l’Abbaye Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 20 communes du canton situé dans le département de la Côte-d’Or
Étude menée de 2005 à 2008 Habitat de la Bresse bourguignonne Inventaire architectural de l’habitat traditionnel de six cantons de la Bresse bourguignonne : cantons de Cuisery, Louhans, Montret, Pierre-de-Bresse, Saint-Germain-du-Bois et Saint-Germain-du-Plain.
Étude menée en 2008 Oeuvres d'art issues du 1% artistique dans les lycées de Bourgogne 95 oeuvres d'art, identifiées comme issues de la procédure du 1% artistique, ont été recensées dans les lycées bourguignons. Elles sont dues à des artistes aussi bien locaux qu'étrangers, parfois de grand renom.
Étude menée de 2001 à 2007 Patrimoine astronomique de Franche-Comté Créé en 1878, l'observatoire de Besançon a évolué en fonction des innovations technologiques ; il est aujourd'hui spécialisé dans le Temps-fréquence, l'astrophysique des grands relevés et la dynamique et photo-physique des milieux dilués.
Étude menée en 2003 et 2006 Canal du Rhône au Rhin à Besançon Destiné à relier la Saône au Rhin en empruntant le cours du Doubs, le canal du Rhône au Rhin s'étend actuellement sur 323 km, traversant du sud au nord les régions Bourgogne-Franche-Comté et Grand-Est, soit sept départements : Côte-d'Or, Jura, Doubs, Haute-Saône, Territoire de Belfort, Haut-Rhin et Bas-Rhin.
Étude menée en 2005 Aire de La Grandvallière Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 17 communes du canton situé dans le département du Jura
Étude menée de 2003 à 2005 Patrimoine métallurgique de la Nièvre Inventaire de l'ensemble du patrimoine métallurgique de la Nièvre représenté par ses forges, ses hauts fourneaux, ses usines de transformation ou de fabrication de métaux spéciaux ou non, subsistants ou disparus.
Étude menée en 2004 Voie ferrée Andelot-La Cluse La construction de la ligne à voie unique qui relie Andelot-en-Montagne (Jura) à La Cluse (Ain) s'est étalée sur une cinquantaine d'années, de 1865 à 1912. Une si longue durée traduit les doutes existants quant à la rentabilité de cette ligne mais aussi les difficultés dues à la topographie, notamment dans la région de Morez et Saint-Claude. La multiplication des ouvrages d'art fait de cette voie ferrée un ensemble remarquable.
Étude menée entre 1986 et 2003 Canton de Verdun-sur-le-Doubs Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 24 communes du canton situé dans le département de la Saône-et-Loire
Étude menée entre 2001 et 2003 Ville de Semur-en-Auxois Étude de l’architecture et des objets mobiliers de la ville de Semur-en-Auxois située dans le département de la Côte-d’Or
Étude menée en 2003 Cathédrale de Saint-Claude La cathédrale de Saint-Claude est l’insigne témoin d’un monastère fondé au 5e siècle, dont l’abbé le plus célèbre, saint Claude (485/490 à 512/514), fut à l’origine d’un pèlerinage renommé à partir du 12e siècle.
Étude menée de 2001 à 2003 L’architecture rurale du Parc naturel régional du Morvan Inventaire du patrimoine rural bâti sur les communes des départements de la Côte-d’Or et de l’Yonne situées dans l’emprise du Parc naturel régional du Morvan.
Étude menée en 1988-1992 et 2000-2002 Peintures murales en Bourgogne Recensement des peintures murales dans près de 800 édifices répartis sur les quatre départements bourguignons (Côte-d’Or, Nièvre, Saône-et-Loire et Yonne).
Étude menée de 1999 à 2002 Patrimoine industriel du Territoire de Belfort L'étude porte sur 137 sites industriels englobant usines, cités ouvrières, logements ouvriers et patronaux, fermes et tout autre bâtiment lié à la production industrielle.
Étude menée entre 1988 et 2001 Patrimoine de la ville de Beaune (intra-muros) Etude du centre-ville de Beaune, de son architecture et des objets mobiliers de certains édifices.
Étude menée de 1998 à 2000 Patrimoine industriel de la communauté urbaine Le Creusot-Montceau Étude de l’architecture et des objets mobiliers liés au patrimoine industriel sur le territoire de la communauté urbaine Le Creusot-Montceau.
Étude menée de 1999 à 2000 Morez Dépendant de La Mouille, possession des abbés de Saint-Claude, la vallée de la Combe noire est colonisée au 15e siècle avec l'installation d'établissements hydrauliques près du confluent de la Bienne et de l'Évalude. Elle prend le nom de Combe à Morel (à la suite de l'installation vers 1565 d'un forgeron nommé Etienne Morel), abrégé en Morey puis Morez.
Étude menée de 1999 à 2000 Canton de Morez Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 10 communes du canton situé dans le département du Jura
Étude menée entre 1989 et 1998 Lavoirs en Bourgogne Inventaire des lavoirs situés en Côte-d’Or et Saône-et-Loire.
Étude menée entre 1986 et 1998 Canton de Saint-Martin-en-Bresse Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 9 communes du canton situé dans le département de la Saône-et-Loire
Étude menée de 1988 à 1998 Patrimoine industriel du Jura De l’usine Solvay de Tavaux à la fromagerie de la Doye, de la machine à débiter le marbre au mécanisme d'horloge... 600 dossiers ont été constitués sur le patrimoine industriel du Jura dans toute sa diversité : usines, machines, logements patronaux, cités ouvrières, etc. 202 des 545 communes du département sont concernées.
Étude menée entre 1976 et 1997 Canton de Guillon Étude de l’architecture et des objets mobiliers des 17 communes du canton situé dans le département de l’Yonne